科研服务
细菌/真菌全基因组测序,是指基于第二代高通量测序和第三代单分子实时测序技术,对细菌/真菌全基因组进行测序,利用生物信息分析手段,得到细菌/真菌的全基因组序列,解析编码信息和表观遗传修饰信息,并获得相应的变异信息。依据实验目的和待测样本与参考基因的序列相似性,可分为细菌/真菌全基因组(近)完成图测序、框架图测序和全基因组重测序。
细菌/真菌全基因组测序,可在致病性、耐药性、环境适应性、代谢途径等多角度进行功能基因的深入挖掘,对微生物不同的表型等特性进行深层次研究。
服务优势
- 经验丰富,完成微生物基因组项目10000+。
- 多测序平台,提供多种测序方案。
- 专业的售后服务体系,经验丰富的微生物数据挖掘团队,省时、省心、省力。
技术路线
分析内容展示
案例解读
研究背景
生物解毒技术已经发展成熟,利用微生物如细菌、酵母和真菌来消除霉菌毒素污染。 然而,由于缺乏相关酶的分子细节,许多真菌毒素解毒的潜在机制仍不清楚。下一代测序技术提供了能够降解真菌毒素的微生物的大量基因组数据,使得利用生物信息学技术研究相关酶的分子细节成为可能。
研究结论
本研究进行了Apiotrichum mycotoxinivorans的全基因组测序,通过生物信息学分析得到了推定的Baeyer-Villiger单加氧酶(BVMOs)和用于玉米赤霉烯酮(ZEA)降解的羧基酯水解酶。 我们开发了第一个用于底物特异性酶的基因组规模预测的流程,可建立同源的结构和分子对接模型来展示相关的降解酶作用。本研究中开发的酶预测工作流程处理GPSE,可能有助于加速新解毒酶的发现。
(具体细节请咨询我司技术人员)
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